Le retour de Ridley Scott à la franchise Alien devait mettre tout le monde d'accord. Et pourtant, il semblerait que le réalisateur rencontre des difficultés à convaincre 20th Century Fox de ses choix. Premier point de discorde : alors que chacun des quatre épisodes de la franchise avaient été classés R (interdit aux moins de 17 ans non accompagnés), Scott doit rendre un PG-13 (interdit aux moins de 13 ans non accompagnés). Avec un budget dépassant les 200 millions de dollars, il est d'un point de vue strictement financier inconcevable pour le studio que le film se coupe de son public adolescent. Fox tente de rassurer son monde en rappelant que The Dark Knight avait écopé d'un simple  PG-13 malgré sa noirceur.

Autre sujet qui fâche : le casting. Si Fox penche pour qu'une star de la trempe de Charlize Theron tienne le premier rôle, Ridley Scott souhaiterait de son côté signer la fille qui rêvait d'un bidon d'essence et d'une allumette, Noomi Rapace. La comédienne suédoise révélée dans l'adaptation cinéma de le trilogie Millenium de Stieg Larsson est effectivement à ce jour une totale inconnue aux Etats-Unis. Six mois après la remise des rênes à Ridley Scott, Alien - La préquelle demeure encore bien flou...